CE认证和3C认证主要有以下区别：

- 适用地区：CE认证适用于欧盟27国及欧洲自由贸易联盟3国等欧盟市场。3C认证是中国境内的强制性认证，适用于在中国市场销售的产品。

- 认证性质：CE认证是强制性安全认证。3C认证是强制性安全与质量认证，更强调产品对消费者生命安全和国家安全的保障。

- 认证机构：CE认证可选择多家欧盟认可的NB公告机构。3C认证由中国质量认证中心（CQC）及相关指定机构负责。

- 是否验厂：CE认证大部分产品不需要验厂，仅少数安全要求高的产品或大型机构检测时可能要求验厂。3C认证需要初次审厂和年度监督检查。

- 证书有效期：CE认证证书通常长期有效，但标准更新时可能需重新认证。3C认证证书有效期为5年，且每年需进行年审。

- 执行标准：CE认证遵循欧盟的EN标准体系。3C认证遵循中国的GB国家标准。

- 产品范围：CE认证产品范围广泛，几乎涵盖所有类型产品。3C认证有明确的强制性产品目录，主要包括电线电缆、电动工具、家用和类似用途设备、音视频设备等100多种产品。

- 认证周期：CE认证周期较短，通常为1-4周。3C认证周期较长，一般需要2-3个月，包含工厂审查时间。

- 认证模式：CE认证可选择自我声明或第三方认证等模式。3C认证必须由第三方认证机构进行认证。

- 费用水平：CE认证费用相对较低。3C认证因包含验厂等环节，费用相对较高。

企业可根据以下原则选择认证：

- 仅在我国销售：若产品在3C认证强制性目录内，必须办理3C认证，以符合中国市场准入要求，否则产品不得在中国市场销售。

- 仅出口欧盟：办理CE认证，使产品符合欧盟法规要求，获得进入欧盟市场的通行证。

- 既内销又出口欧盟：需同时办理3C认证和CE认证，以分别满足中国和欧盟市场的准入规定，确保产品能在两个市场合法销售。